Jean Quatremer couvre l’actualité européenne pour Libération depuis septembre 1990, d’abord comme responsable du défunt cahier Europe - un supplément hebdomadaire de huit pages consacré à la construction communautaire - puis comme correspondant auprès de l’Union. Auparavant, il s’est occupé au sein du service société du même journal, des questions d’immigration mais aussi, plus largement, de tout ce qui touchait, de près ou de loin, au droit. Il a écrit ses premiers papiers pour Libération en 1984.

Après des études de droit (spécialisation en droit international privé et droit européen), il a enseigné comme chargé de travaux dirigés à la faculté de droit (essentiellement à Paris X-Nanterre). Il a également travaillé dans un cabinet d’avocats au Conseil d’Etat et à la Cour de cassation.

Jean Quatremer est l’auteur de deux ouvrages, tous deux consacrés à l’Europe : Ces hommes qui ont fait l’euro, querelles et ambitions européennes (Éd. Plon, Mars 1999), écrit en collaboration avec Thomas Klau, journaliste au Financial Times Deutschland, raconte les coulisses de la construction de l’Europe monétaire vu des deux côtés du Rhin ; Les maîtres de l’Europe (Éd. Grasset, Mai 2005) co-écrit avec Yves Clarisse, journaliste à l’agence de presse Reuters, décrit la grandeur et les misères de l’Union européenne entre 1995 et 2005, c’est-à-dire entre la fin des années Delors et le référendum français sur la Constitution européenne. Il a participé à des ouvrages collectifs dont : Notre Europe, dirigé par Michel Rocard et Nicole Gnesotto (Robert Laffont, 2008).

Outre de nombreuses collaborations extérieures, pour d'autres journaux et radios, en France ou à l'étranger, il a également réalisé ou écrit toute une série de documentaires pour la télévision (Arte, France 2, France 5).

Son blog Les Coulisses de Bruxelles, lancé en décembre 2005, a obtenu le prix Louise Weiss du journalisme européen le 9 mai 2006. C'est la première fois qu'un blog reçoit un tel prix.

Le 13 février 2009, il reçoit le prix Konstantinos Kalligas, un prix remis par la presse grecque pour sa couverture européenne et son "éthique journalistique". En mars prochain, il recevra le prix « Richelieu », parrainé par la Délégation générale à la langue française et les éditions Larousse, qui récompense un journaliste qui « aura témoigné par la qualité de son propre langage, de son souci de défendre la langue française »

Il préside, depuis septembre 2008, la section française de l'association des journalistes européens (AJE) et il est membre, depuis 2007, du jury du Prix du livre européen, et depuis 2009, du jury du prix Louise Weiss.